Ранее известен как «Музей западного и восточного искусства» был открыт в 1919 году.
Ядром коллекции стало частное собрание выдающихся украинских меценатов конца 19 — начала 20 веков Богдана Ивановича и Варвары Николовны Ханенко. В течение нескольких десятилетий они формировали свою коллекцию, которая, безусловно, стала проявлением личного вкуса владельцев. Богдан Иванович и Варвара Николовна принадлежали к той категории коллекционеров, которые были защищены от внешнего влияния. Собирали то, что соответствовало их взглядам и ощущениям. Уже в начале 20 века коллекция была высоко оценена в среде знатоков и признана лучшей среди новых частных коллекций того времени.
Сейчас в собрании музея имеется около 17 000 произведений живописи и скульптуры. К сожалению, площадь Киевского музея искусства им. Богдана и Варвары Ханенко не позволяет одновременно выставлять более 2 000 экспонатов